João Evangelista de Magalhães teve 2 filhas com ?.
Filha 1. Mécias Evangelista de Magalhães (nascida no Brasil, falecida no Brasil, filha de João Evangelista de Magalhães e de ?).
Filha 2. Ana Izabel de Magalhães Lara (nascida no Brasil, falecida, filha de João Evangelista de Magalhães e de ?).
Teve 4 filhos com Ana Joaquina das Chagas.
Filho 3. Antônio Caetano de Magalhães (nascido no Brasil, em 23 fev 1843, falecido no Brasil, filho de João Evangelista de Magalhães e de Ana Joaquina das Chagas).
Filha 4. Maria do Carmo de Magalhães (nascida no Brasil, em 1844, falecida no Brasil, filha de João Evangelista de Magalhães e de Ana Joaquina das Chagas).
Filha 5. Virginia Augusta de Magalhães (nascida no Brasil, falecida no Brasil, filha de João Evangelista de Magalhães e de Ana Joaquina das Chagas).
Filho 6. Paulo Augusto de Magalhães (nascido no Brasil, falecido, filho de João Evangelista de Magalhães e de Ana Joaquina das Chagas).